Bioinformatics platform development for next generation bioinformation analysis (안씀)

차세대 생명정보 분석을 위한 생명정보학 플랫폼 개발 과제
  Bioinformatics platform development for next generation bioinformation analysis

  • 주관 기관 : (주)테라젠이텍스
  • 협력 기관 : 한국과학기술원, (주)케이티, (주)신테카바이오, 숭실대학교

1.연구 목적
  본 과제의 최종 목표는 차세대 생명정보 분석을 위한 생명정보학 플랫폼을 개발하는 것이다. 본 플랫폼 개발에는 대용량 데이터의 저장이나 분석을 위한 데이터 전처리 및 분석을 위한 클라우드 시스템 개발을 한다. 이에 따른 데이터 전처리, 생명정보 분석을 위한 파이프라인과 생명정보 분석 플랫폼을 쉽게 사용할 수 있도록 사용자 편의적인 인터페이스가 필요하다. 최종적으로는 바이오메디컬 DB와 위의 요소들을 통합한 최적의 오믹스 분석 기술 시스템을 구축하여 신속한 고부가가치 상용화 서비스를 실현하고자 한다. 본 기관에서는 생명정보 분석을 위한 파이프라인 생성 시스템 기술 개발을 통해 다양한 생명정보를 효율적으로 분석할 수 있는 파이프라인 구성이 가능함을 확인하였고, 이를 실질적으로 구현하여 관련 기술 테스트를 수행한다.

2.연구 내용

  1. GiFlowDesigner 고도화
    1. 파이프라인 생성 시스템 고도화
      1. 정의: 하나의 컴포넌트를 구성하면 자동으로 그것과 연계될 수 있는 입출력 모듈 목록을 보여줌으로써 사용자 편의성을 높일 수 있고, 또한 성공적으로 작성 완료된 파이프라인을 하나의 모듈처럼 재활용함으로써 유사한 작업들에 대한 실수 예방은 물론 생산성을 높임으로써 파이프라인 생성 시스템을 활용도를 재고할 수 있다.
      2. 개발 범위 :
        • 연계 모듈 자동 추천 기능
        • 생성 파이프라인의 모듈화 기능

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          그림. 자동 추천 기능 예시

  2. 네트워크 기반 첨단 슈퍼컴퓨팅 신기술 개발 연구
    1. 이종 클라우드 간의 연동 통합 기술 개발
      1. 정의: 최근의 클라우드 컴퓨팅은 다수의 관리 주체에 의해 운영 제공되는 다수의 이종 서비스 환경 형태로 존재한다. 이에 따라 대용량의 생명정보 분석을 위해서는 네트워크를 기반으로 이종 클라우드 간의 연동 통합 기술이 필요하며, 이를 통해 다양한 분석 작업을 고속으로 처리할 수 있다.
      2. 개발 범위
        • 응용 서비스 상태 모니터링 기술 연구
        • 사용자 SLA 파라미터의 응용 서비스로의 매핑 및 측정 기술 연구

          monitoringtech

          그림. 응용 서비스 상태 모니터링 기술 개념도